Materské mlieko prirodzene obsahuje prebiotické oligosacharidy (galaktooligosacharidy – GOS), ktoré stimulujú črevnú mikroflóru a podporujú rast prospešných baktérií v čreve, vďaka čomu napomáhajú k správnej funkcii imunitného systému. Niektoré dojčenské a batoliace mlieka obsahujú zmes prebiotík GOS/FOS, ktoré sú inšpirované výskumami materského mlieka.
Aj LCP mastné kyseliny (kyseliny omega 3 a omega 6) majú dôležitú úlohu pri vývoji dieťaťa, sú nevyhnutné pre vývoj mozgu a prispievajú k správnej funkcii imunity. Detský metabolizmus si však na rozdiel od dospelých ešte nedokáže LCP mastné kyseliny v dostatočnej miere sám vytvárať, a preto ak nemôže byť dieťa dojčené, malo by ich dostávať v strave, najlepšie v umelej mliečnej výžive.